Au début du XVIe siècle, l'édifice d'alors que le grand incendie de 1524 a ravagé, fait place à un édifice en pierre dont la construction dura jusqu'en 1536. Des terrains voisins sont annexés en 1527 pour rebâtir une église plus vaste. Paroisse de bourgeois riches, ils parent leur église paroissiale de nombreuses œuvres d’art (statues, vitraux). Après la Révolution y sont rassemblées des sculptures du XVIe siècle sauvées d’autres édifices.
En 1570, les parties basses sont couvertes d’un toit provisoire et le haut est achevé un siècle plus tard. Les travaux reprennent en 1660 pour le rehaussement qui commença par le chœur et finit en 1675 par les toits. Autour de 1740, on ajoute une travée et la façade de style classique.
Les vitraux historiés forment un remarquable ensemble. Les verrières de l’Histoire de Daniel et de La Passion, datées de 1531, marquent un tournant pour l’Ecole troyenne de peinture sur verre qui avait jusqu’alors privilégié les coloris intenses. Les vitraux sont peints en grisaille brune rehaussée de jaune d’argent sur du verre blanc, à l’exception de l’Histoire de la croix et des armoiries des donateurs. Cette absence de couleur marque un tournant décisif dans la peinture sur verre troyenne qui se caractérisait par une coloration vive
[1] Christ en croix.
[2] Suzanne est observée par deux vieillards alors qu'elle prend son bain.
[3] Accusée par les deux vieillards, l’affaire est portée devant le peuple.
[4] En punition de leur calomnie, les deux vieillards sont condamnés à mort par lapidation.
[5] Daniel refuse de sacrifier aux idoles.
[6] Le roi Darius, à contrecœur, fait jeter Daniel dans une fosse aux lions.
[7] Les lions ne s'attaquent pas à Daniel.
[8] Darius se rend à la fosse aux lions où il retrouve Daniel sain et sauf.
[9] Darius fait jeter les calomniatreurs dans la fosse avec leurs femmes et leurs enfants.
[10] le roi Balthazar organisa un banquet en l'honneur de ses dignitaires.
[11] ni les devins, ni les magiciens, ni les astrologues ne purent interpréter l'inscription sur le mur « mene mene tekel upharsin ».
[12] le texte est décodé puis interprété par Daniel.
[13] La menace divine se réalisa puisque Balthazar mourut la nuit même et Darius accéda au trône.
[1] Armoirie
[2] L'entrée à Jérusalem
[3] Sainte Barbe
[4] Jésus au mont des oliviers
[5] Armoirie
[6] Le baiser de Judas
[7] Jésus devant Caïphe
[8] La flagellation
[9] Christ aux injures
[10] Jésus est condamné
[11]
[12] Ecce Homo
[13] Pilate
[14] Portement de croix
[15] Jésus est cloué sur la croix
[16] Le jugement dernier