En 582, l’évêque Gallomagne apporte à Troyes les reliques de Nizier, primat de Lyon très vénéré dans la région et mort en 573. Il les place à l’église Saint-Maur, construite à la fin du Ve siècle qui prend alors le nom de Saint-Nizier. Les travaux de construction de l'église actuelle s'étalent de 1528 à 1619. L'église est consacrée dès 1542 sans que la nef soit couverte (elle ne le sera qu'en 1582).
À l’intérieur de l’église, on admire l’ampleur des nefs gothiques et leur clarté. Les vitraux, ensemble exceptionnel de l’École troyenne, illustrent des sujets de l’Ancien et du Nouveau Testament, ainsi que de l’histoire ou des légendes troyennes : Passion, Calvaire, Résurrection, Pentecôte, vie de saints et de saintes, arbre de Jessé, Apocalypse, Jugement dernier, etc.
Le festin de Balthazard
[6] Les apôtres Pierre, Jacques et Jean, témoins de la transfiguration (le Christ est remplacé par la Vierge)
[5] Daniel dans la fosse aux lions
[4] Daniel est invité au festin de Balthazar et déchiffre l’inscription. Il est chassé
Suzanne et les vieillards
[3] Suzanne est conduite au supplice. Daniel l’innocente et les vieillards sont exécutés
[2] Suzanne au bain est accusée et condamnée
[1] anges musiciens
[1] La Femme vêtue de soleil
[2] L’Enfant Jésus échappe au serpent infernal
[3] La bête à deux têtes
[4] Ouverture du livre aux sept sceaux
[5] Chute de grêle et pluie de feu sur les hommes
[6] Dieu distribue les trompettes aux anges
[7] Les quatre cavaliers de l'apocalypse
[8] Les anges exterminent les ennemis de Dieu
[9] Dieu tient une faucille
[10] Adoration de la bête à sept têtes et la bête à deux cornes
[1] Saint-Nizier sur un trône.
[2] Un ange donne une bourse à une femme (scène liée à l'iconographie mariale).
[3] [4] donateurs.
[5] Miracle des 2 jeunes filles couronnées par un ange et sauvées de la diffamation par la Vierge.
[6] L'Annonciation.
[7] [8] Les 12 apôtres se réunissent pour assister à la mort de la Vierge.
[9] [10] Dormition de la Vierge.
[11] [12] Ensevelissement et légende des mains coupées.
[13] Membres d'une confrérie.
[14] Des anges accompagnent l'ame de la Vierge.
[15] Vierge de pitié.
[A] Concert céleste avec bénédiction divine,
[B] Nicolas exorcise un possédé.
[C] il sauve un pendu.
[D] [E] Miracles posthumes au moment de sa mise en bière.
[1] Sainte Marguerite.
[2] Saint Nicolas sacré évêquede Myre.
[3] Dotation aux trois jeunes filles.
[4] Naissance de Nicolas.
[5] Saint Nicolas sauve les 3 enfants du saloir.
[6] Saint Nicolas sauve les 3 officiers.
[7] Nicolas sauve un navire pris dans la tempête.
[8] Nicolas commande à 2 bûcherons de couper un arbre consacrés à Diane.
[9] Charité de saint Nicolas.
[10] Saint Nicolas et l'Empereur Constantin.